Pergola to element małej architektury, który często występuje w ogrodach botanicznych. Jest to konstrukcja wsporcza, zazwyczaj zbudowana z drewnianych lub metalowych belek, która tworzy osłonięte przejścia lub miejsca do odpoczynku. Pergole są często sadzone wśród roślin pnących, co pozwala na stworzenie przyjemnych, zacienionych przestrzeni. W kontekście ogrodów botanicznych pergole pełnią nie tylko funkcję estetyczną, ale także praktyczną, umożliwiając wizytatorom obserwację różnorodnych gatunków roślin w komfortowych warunkach. W dobrych praktykach projektowych ogrodów botanicznych zaleca się tworzenie takich przestrzeni, które łączą funkcjonalność z edukacją ekologiczną, a pergole są doskonałym przykładem takiej integracji. Często spotyka się je w różnych stylach architektonicznych, co zdecydowanie wpływa na charakter całego ogrodu, a także na jego mikroklimat.
Atrium, piaskownica oraz wirydarz to elementy, które mogą być mylone z pergolą, jednak każdy z nich pełni inną funkcję oraz ma inną charakterystykę. Atrium to przestrzeń wewnętrzna, często centralna w budynku, która może być otwarta na niebo, ale nie jest to konstrukcja, która występuje w ogrodzie botanicznym jako element małej architektury. Może być wykorzystywana w architekturze miejskiej lub w domach prywatnych, ale nie w kontekście formowania przestrzeni zielonej. Piaskownica to wyposażenie, które w większości spotykane jest w przestrzeniach zabaw dla dzieci, a nie w ogrodach botanicznych, gdzie celem jest prezentacja przyrody, a nie zabawy. Wirydarz, z kolei, to zamknięta przestrzeń ogrodowa, zazwyczaj otoczona budynkami, która była popularna w architekturze klasztornej, a nie jest elementem typowym dla ogrodu botanicznego. Kluczowym błędem w tym rozumieniu jest mylenie funkcji różnych elementów małej architektury oraz ich zastosowań w kontekście projektowania przestrzeni zielonych. Każdy z wymienionych elementów ma swoje unikalne miejsce i zastosowanie, ale żaden z nich nie odzwierciedla charakterystyki pergoli, która jest przeznaczona do tworzenia zewnętrznych, otwartych przestrzeni, sprzyjających interakcji z roślinnością.