Protokooperacja to forma interakcji międzygatunkowej, w której dwa organizmy korzystają na swoim współistnieniu, ale nie są od siebie bezpośrednio zależne. W opisywanym przypadku kraby pustelniki korzystają z jamochłonów, które zapewniają im lepsze maskowanie i ochronę przed drapieżnikami. Za to jamochłony otrzymują resztki pokarmu, które nie zostały zjedzone przez pustelnika. Tego rodzaju współpraca jest korzystna dla obu stron, ale nie jest niezbędna do przetrwania. W praktyce można zauważyć przykłady protokooperacji w wielu ekosystemach, np. niektóre gatunki ryb korzystają z ochrony, jaką zapewniają im morskie gąbki, podczas gdy te ostatnie otrzymują zyski z usuwania resztek organicznych. Zrozumienie protokooperacji jest istotne w ekologii, ponieważ pozwala lepiej analizować złożoność interakcji w ekosystemach oraz wpływ na bioróżnorodność i stabilność tych systemów. Dobrą praktyką w badaniach ekologicznych jest też monitorowanie takich interakcji, co może przyczynić się do ochrony gatunków oraz ich siedlisk.
Zarówno konkurencja, jak i pasożytnictwo oraz mutualizm to istotne pojęcia w ekologii, ale nie pasują one do opisanego przypadku. Konkurencja zachodzi, gdy dwa organizmy walczą o te same zasoby, co nie jest tym, co obserwujemy między pustelnikiem a jamochłonem. W tym przypadku obie strony współpracują, a nie konkurują. Pasożytnictwo natomiast odnosi się do relacji, w której jeden organizm (pasożyt) czerpie korzyści kosztem drugiego (żywiciela), co również nie ma miejsca w tej interakcji, ponieważ ani pustelnik, ani jamochłon nie są w pełni zależni od siebie. Mutualizm zakłada z kolei silną więź, w której organizmy są od siebie uzależnione w sposób, który jest niezbędny do ich przetrwania. W przypadku jamochłonów i pustelników, obie strony zyskują, ale mogą również funkcjonować niezależnie. Przykłady błędnych wniosków obejmują mylenie korzyści płynących z interakcji z jej niezbędnością. Ważne jest, aby w analizach ekologicznych dostrzegać subtelności interakcji między gatunkami i unikać uproszczeń, które mogą prowadzić do fałszywych interpretacji różnych relacji ekologicznych.