Na właściwości struktury gruzełkowatej gleby wpływ mają czynniki negatywne
Erozja wodna i wietrzna ma negatywny wpływ na strukturę gruzełkowatą gleby, ponieważ prowadzi do utraty jej drobnoziarnistej i aglomeracyjnej struktury. Procesy erozyjne, wywołane przez działanie wody i wiatru, mogą prowadzić do usuwania cząstek glebowych, a także do ich rozdrobnienia. W efekcie gleba traci swoje naturalne właściwości, takie jak zdolność do zatrzymywania wody oraz przyswajania składników odżywczych. W praktyce oznacza to, że gleby narażone na erozję będą mniej produktywne, co ma wpływ nie tylko na plony rolnicze, ale również na jakość ekosystemów. Dobre praktyki w zakresie ochrony gleby, takie jak stosowanie roślin okrywowych, budowa tarasów, czy systemy nawadniające, mogą pomóc w minimalizowaniu skutków erozji. Wiedza na temat erozji oraz jej wpływu na strukturę gleby jest niezbędna dla rolników i specjalistów zajmujących się ochroną środowiska, aby podejmować odpowiednie kroki w celu ochrony cennych zasobów glebowych.
W niektórych przypadkach zamarzanie i rozmarzanie gleby mogą wydawać się wpływać na jej strukturę, jednak w rzeczywistości te procesy są bardziej związane z cyklem wodnym i mogą mieć zarówno pozytywne, jak i negatywne skutki dla gleby. Zamarzanie powoduje, że woda w glebie przechodzi w stan stały, co może prowadzić do powstawania pęknięć w strukturze gruzełkowatej. Jednak proces ten, zwany mrozem, może także sprzyjać tworzeniu się porów, które poprawiają napowietrzenie gleby. Substancja organiczna, z drugiej strony, jest kluczowym elementem utrzymania struktury gleby. Przyczynia się do tworzenia agregatów glebowych, co sprzyja lepszemu zatrzymywaniu wody i składników odżywczych. Nawilżanie i wysychanie gleby mogą wpływać na jej strukturę, ale proces ten nie jest bezpośrednio szkodliwy dla gruzełkowatej struktury. Równocześnie, woda i powietrze w glebie są niezbędne do rozwoju organizmów glebowych, które przyczyniają się do poprawy jej struktury. W wielu przypadkach, mylenie wpływu czynników fizycznych na strukturę gleby prowadzi do błędnych wniosków, które mogą mieć poważne konsekwencje dla praktyk agrarnych i zarządzania glebami.