Dezynfekcja jest kluczowym zabiegiem w zakresie ochrony zdrowia zwierząt, szczególnie w przypadku ferm drobiu, gdzie ryzyko wystąpienia chorób zakaźnych jest wysokie. Dezynfekcja polega na stosowaniu środków chemicznych, które eliminują drobnoustroje, wirusy i bakterie z powierzchni oraz z obiektów w środowisku fermy. Przykładem jest użycie preparatów na bazie chloru lub aldehydów, które są skuteczne w zabijaniu patogenów. W praktyce, dezynfekcja powinna być przeprowadzana regularnie, szczególnie pomiędzy cyklami produkcyjnymi lub po wystąpieniu choroby. Zgodnie z dobrą praktyką hodowlaną, fermy powinny mieć opracowany plan dezynfekcji, który uwzględnia także czasy działania środków dezynfekcyjnych oraz właściwe metody aplikacji. Utrzymywanie czystości i dezynfekcja pomieszczeń oraz sprzętu są niezbędne dla zachowania zdrowia ptaków i minimalizacji ryzyka zakażeń. Odpowiednia dezynfekcja wpływa również na poprawę wydajności produkcji, co ma bezpośredni wpływ na zyski hodowców.
Bioasekuracja, choć ważna, nie jest najbardziej efektywnym sposobem na maksymalne zmniejszenie liczby drobnoustrojów chorobotwórczych. Skupia się głównie na prewencji i ochronie przed wprowadzeniem oraz rozprzestrzenieniem chorób, jednak sama w sobie nie eliminuje już obecnych patogenów. Deratyzacja, czyli zwalczanie gryzoni, ma swoje uzasadnienie w kontekście zdrowotnym, gdyż gryzonie mogą być nosicielami wielu chorób, ale nie wpływa bezpośrednio na redukcję drobnoustrojów w otoczeniu. Dezynsekcja, związana z eliminacją owadów, również nie jest wystarczająca, gdyż nie dotyczy mikroorganizmu. Często występuje błędne przekonanie, że działania prewencyjne mogą zastąpić konkretne zabiegi dezynfekcyjne, co prowadzi do zaniedbań w utrzymaniu czystości i dezynfekcji. Kluczowe jest zrozumienie, że dezynfekcja jest w rzeczywistości niezbędnym krokiem do redukcji zanieczyszczeń biologicznych i należy ją traktować jako integralną część programu bioasekuracji. Właściwe połączenie tych wszystkich działań przynosi największe korzyści dla zdrowia drobiu.